因事实不清证据不足，检察院作出不起诉决定后如何启动国家赔偿程序？
首先更正一点：并不是检察院做出不起诉决定就一定能申请国家赔偿。因为
我们国家的《国家赔偿法》确定的赔偿原则是，对被错误羁押的经济损失的补偿，而不是对错误追诉名誉损失的赔偿。换句话说就是，只有被错误羁押了，才有可能申请国家赔偿。2.不起诉分为三种，分别是绝对不起诉，相对不起诉和证据不足不起诉。绝对不起诉就是查明没有犯罪事实或者嫌疑人没有实施犯罪，作出的不起诉决定；
相对不起诉也称为酌定不起诉，是指检察院认为情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
另外就是证据不足不起诉，就是检察院认为在案据以定罪的证据不足，事实不清，检察院作出的不起诉决定。
3. 是不是三种不起诉都可以申请国家赔偿？当然不是，根据国家赔偿法，如果是相对不起诉，就不需要赔偿。所以需要国家刑事赔偿的不起诉情形是绝对不起诉和存疑不起诉。
4. 另外，国家赔偿的日期从什么时候起算？是从刑事拘留之日开始还是从逮捕之日开始？答案是从刑事拘留之日起算。
拘留
如果犯罪嫌疑人仅仅被拘留而没有被逮捕，那么他只能在两种情况下可以申请国家赔偿。第一种情况是，公安机关违反法定程序拘留犯罪嫌疑人，比如没有出示拘留证、没有在24小时内送到看守所并讯问等；第二种情况是公安机关拘留犯罪嫌疑人超过法定期限，根据法律规定，公安机关拘留犯罪嫌疑人的最长期限是37天，如果超过了37天就可以申请国家赔偿。
当然，如果公安机关怀疑某人构成犯罪，通过法定程序将其拘留，事后查明他是清白的，在37天以内解除拘留措施，那么该犯罪嫌疑人也只能被白白拘留37天自认倒霉。
逮捕
无论犯罪嫌疑人有没有被拘留，只要他被检察院批准逮捕了，如果事后查明他是无辜的并做出不起诉决定，那么他就可以向检察院申请国家赔偿。之所以这样规定，一方面是因为逮捕的审批程序更加严格，对错误的容忍程度更低；另一方面是因为逮捕的羁押期限很长，对无辜的犯罪嫌疑人的伤害极大。因此，只要逮捕了无辜之人，他就可以申请国家赔偿。
